本发明公开了一种基于谐分量分解的转子振动保护方法，通过采集同一个转子上前后两个轴瓦处的轴振数据，并对其进行谐分量分解，X和Y向转子一阶振动同相分量，通过对这些数据的变化和比对来判断转子的振动情况，判断是否跳机保护。本发明相比现有技术具有以下优点：通过对前轴和后轴的轴瓦处的振动数据的分析，可以达到监测整个转子的振动；同时，对轴振值进行分段保护设置，避免了单点保护造成的保护误动，能有效避免了误触动跳机的情况；根据正常时段内的数值的跟踪，能够实时更新参照基础，迅速判断出转子振动的异常情况，并据此判断是否跳机。这样防止了在一些场合下，由于背景振动的干扰造成机组过于敏感，频繁跳机影响生产的情况。