本发明公开了一种核形石成因机制的分析方法，属于地质领域。该方法包括：确定多个核形石样品的宏观特征和微观特征；确定多个核形石样品中稳定同位素的含量和微量元素的含量；根据多个核形石样品的宏观特征、微观特征、多个核形石样品中稳定同位素的含量和微量元素的含量、以及在目标地区的核形石形成时目标地区的海水的稳定同位素的含量和微量元素的含量，分析目标地区的核形石的成因机制。本发明实施例通过对目标地区多个核形石样品的宏观特征、微观特征及多个核形石样品的稳定同位素和微量元素进行定量—半定量测试，分析目标地区的核形石的成因机制和核形石形成时的古环境，提高了对目标地区核形石成因机制分析的准确性。