本发明属于分子生物学领域，涉及一种分子标记，具体的，涉及一种与水稻抗白叶枯病基因紧密连锁的分子标记，该分子标记含有Seq ID No.1所示序列。本发明还涉及扩增该分子标记的引物、该分子标记和引物在水稻抗白叶枯病基因定位或水稻遗传育种中的用途，以及一种水稻育种方法。本发明的分子标记将基因组DNA序列与水稻抗白叶枯病联系起来，有利于水稻分子标记辅助育种体系的建立；所述分子标记与水稻抗白叶枯病基因的遗传紧密连锁距离为0.5cM。本发明的分子标记及分子标记扩增引物可以简便、快速、高通量地应用于水稻育种实践和资源及品种鉴定。