本发明公开了一种铁路功率调节器负序实时优化补偿方法，通过建立有功转移电流ΔIp与λ之间及无功补偿电流ΔIq与之间函数关系，进而获得λ与之间的函数表达式；以所述三相电压不平衡度给定值为约束条件，采用最速下降法，计算得到最优有功补偿系数和最优负序无功补偿角，从而得到实时工况下最优的负序补偿电流给定值。本发明所述方法运算量小，可以实时在线精确计算最优补偿功率给定值，实现电气化铁路负序和无功实时优化治理；不仅可以实现牵引变电所负序和无功的综合治理，还能实现RPC补偿功率功率最小运行，从而减少RPC运行电流和损耗，并可以提高RPC长期运行能力，具有良好的工业应用前景。