本发明实施方式公开了一种基于信息融合的结构损伤诊断方法和结构损伤诊断系统，基站与至少一个簇头通信，每一簇头与至少一个传感节点通信，该方法包括：每一簇头接收来自基站的采集指令，并根据采集指令向簇内的各传感节点分配需求信息；每一传感节点根据需求信息采集结构在时域下的特征量信号，提取该信号的相关函数和权值，并发送给簇头；每一簇头根据相关函数和权值以及传感节点的位置获得模态参数，将模态参数与预设健康状况参数进行对比得到簇内结构的损伤诊断信息，并发送给基站；基站根据每一簇头发送的损伤诊断信息生成损伤诊断报告。通过上述方式，本发明实施方式能够提高结构损伤诊断精度、减少通信量、实现对结构的实时诊断。