本发明提供一种智能变电站电能表在线电能误差实时比对测试方法，其测试系统包括同步时钟和与之连接的AD模块，RS485采集模块一，RS485采集模块二，脉冲采集模块一，脉冲采集模块二，通过标准电能表与被测电能表同时接入同一个间隔，并通过采集三相电压电流、标准电能表与被测电能表的RS485抄表数据和电能脉冲数据，获得实时的误差数据。本发明的两台电能表不需要同步，且可实时比对多种数据源，实现冗余比对。本发明的方法可在变电站现场环境下，自动实现电能表数据的采集和实时比对，并且比对的时间间隔范围任意可调，自动实现该时间间隔内的电能数据统计。