本发明公开了一种适用于多舱段航天器的流体回路系统，属于多舱段航天器技术领域，包括：冷板、流体管路、辐射器、四个液路断接器及分离装置；两个冷板分别安装在舱内设备与仪器盘上表面及下表面之间，且两个冷板的环形孔通过管路连通；辐射器固定在密封舱的外表面；液路断接器Ⅰ和液路断接器Ⅱ均通过分离装置安装在制动舱和服务舱对接处；液路断接器Ⅲ和液路断接器Ⅳ安装在回收舱和制动舱对接处；两路流体管路的一端分别与冷板的环形孔连接，另一端顺序通过液路断接器Ⅲ或液路断接器Ⅳ、液路断接器Ⅰ或液路断接器Ⅱ后，穿过服务舱的壳体，并与辐射器的管状结构连接；本发明能够通过对流体管路进行布局和舱间连接设计，而不影响返回舱的姿态。