本发明提供一种基于万有引力算法的独立微网系统设计方法，其包括如下步骤：步骤S1，建立具有多目标评价指标的独立微网系统模型；步骤S2，将多目标评价指标的独立微网系统模型转换为单目标评价指标的独立微网系统模型；步骤S3，选取可并入的风机台数Numwt、光伏电池阵列的并联串数Numpv、蓄电池并联串数Numbat作为优化变量；步骤S4，确定独立微网系统的运行控制策略，优先考虑用可再生能源发电量满足负荷需求，根据可再生能源发电量与负荷所需电量的差值，来决定蓄电池的充放电状态及柴油发电机的开停；步骤S5，利用万有引力算法对独立微网系统模型进行求解。采用该设计方法设计出的独立微网系统具有经济性好、环保性高、可再生能源利用率高、供电安全可靠性高等优点。