本发明公开了一种环氧氯丙烷废水的深度处理方法，首先向部分冷却待处理原废水中通入过量CO2气体，然后将该废水与部分原废水快速混合，使得混合废水温度大于60℃，实现钙离子沉淀去除；出水中加入硫酸铵进一步沉淀去除钙离子，最后连同沉淀一起进行生化处理；在生化处理过程中投加微生物生长促进剂，所述促进剂包括金属盐和多胺类物质，其中金属盐为40～100重量份，多胺类物质为5～30重量份，所述金属盐由钙盐、铜盐、镁盐和/或亚铁盐组成。本发明采用通入过量CO2及利用原废水碱度和余热沉淀去除大部分钙离子，然后加入硫酸铵进一步除钙，最后在生化处理投加微生物生长促进剂的方法实现废水的深度处理，具有处理工艺简单、处理效率高、处理成本低的特点。