本发明公开了一种微生物培养一体化设备，包括箱室及设置于箱室内的恒温气浴循环发生器、空气过滤器、臭氧发生器、紫外灯、操作台装置及振荡装置及控制系统等。操作台装置活动设置于箱室内并用于进行接种操作，于第一状态下展开形成悬于箱室内的平台，第二状态下收叠于所述箱室的侧壁；振荡装置用于带动已接种微生物的培养瓶进行水平反复运动。控制系统用于控制上述各装置动作以实现自动化智能调控。本发明的一体化设备可以进行多种操作，确保了微生物培养过程的连续性，避免染菌，提高微生物培养的成功率。