本发明提供了一种基于惯导系统的旋翼动平衡方法及系统，属于直升机飞行安全领域及旋翼动平衡领域，包括：惯导系统，除用于导航外，同时作为旋翼动平衡传感器，用于获取关于旋翼转速1Ω振动(旋翼动平衡)原始数据；综合显示处理机，至少包含有一个动平衡数据处理模块，用于接收惯导系统发来的数据，对接收到的数据进行分析并与安全门槛值进行对比；显示模块，将旋翼转动平衡时的振动幅值、相位以及超限告警能实时显示给座舱人员。本发明提供了一种基于惯导系统的旋翼动平衡方法及系统，利用直升机惯导系统，通过机载计算机对惯导系统数据进行数学变换获取相应旋翼动平衡振动值，并可以直接显示给飞行员，提升飞行安全。