本发明公开了一种适用于运载火箭电子设备UA级微小电流测试系统及方法，该系统包括电流积分转换电路、信号隔离放大电路、ADC采样电路、控制检测电路，其中：电流积分转换电路，通过积分电路把电流信号转换为可积分的电压信号；信号隔离放大电路，通过第二电压把经过积分后的电压信号与后级采样和运算线路隔离开，同时又等比例放大作用；ADC采样电路，把经过隔离放大电路的输出信号进行采样，采样后的数据送到FPGA芯片进行控制等。本发明能够提供UA级电流测试精度和准确度，以达到运载火箭电爆管控制电路的定性测量的目的，同时进行多路测试，以提高测试效率。