本发明提供了一种具有多流路互联结构的微通道换热器及其制造方法，包括一金属微通道基体，该基体沿冷却液流动方向上设置有若干个平行排布、阵列分布的开口圆环结构，其包括外部沿圆周向均匀间隔布置的四段第一弧形翅片和内部对称布置的两段第二弧形翅片，从而形成了嵌套设置的大开口圆环和小开口圆环。大开口圆环在沿平行、垂直于冷却液流动方向上分别形成前后、上下各两个狭缝，小开口圆环在沿平行于冷却液流动方向上形成前后两个狭缝，上述狭缝形成多流路互联通道。制造时，采用激光铣削技术来加工出该多流路互联微通道结构，将上盖板采用耐热玻璃封装，获得微通道换热器。本发明制造工艺简单、成本低廉，通过破坏边界层强化微通道换热。