本发明提供利用离子液体从虾壳制备甲壳素、蛋白质和有机酸钙方法，属于废弃资源回收利用技术领域，包括如下步骤：(1)低共熔离子液体或其水溶液除去虾壳粉中碳酸钙，得到除钙虾壳粉；(2)磷酸酯类离子液体脱去除钙虾壳粉中的蛋白质，得不溶物，即甲壳素产品；(3)分别收集(1)和(2)步骤中的上清液，加入反萃剂，再生得到的再生物分别是产品有机酸钙和蛋白质。同时，收集含有反萃剂的低共熔离子液体和磷酸酯类离子液体的上层清液。本发明可利用废弃虾壳制备高纯度甲壳素，有机酸钙和蛋白质，实现了虾壳的综合利用。同时，本发明所用离子液体无污染，可循环利用，成本低。