本发明涉及一株生防菌株LE16及其应用。该菌株的特征在于：所述菌株具有LE16 16S rDNA序列表中的核苷酸序列，为产酶溶杆菌（Lysobacter enzymogenes），属于单黄胞科(Xanthomonadaceae)、溶杆菌属(Lysobacter)，保藏登记号CGMCC No.14215。该产酶溶杆菌LE16具有繁殖速度快、营养要求简单、环境适应性良好和根际土壤定植能力强等特点。该菌株在液体培养时具有自溶作用，制备出的发酵液对多种植物病原真菌具有较强的拮抗作用，能有效防治烤烟黑胫病和白粉病。该菌株在植物真菌病害防治上具有巨大的应用潜力。