本发明公开了海中钢圆筒护岸结构多重防腐保护施工方法，步骤为：在加工过程中，在钢圆筒和钢副格外壁以及内壁分别涂覆防腐涂料；将多个钢圆筒和钢副格在海上连接为整体；在每个钢圆筒和钢副格内填充中粗砂至距离钢圆筒以及钢副格上沿一定距离；在中粗砂上方浇筑封顶混凝土，在混凝土外圈浇筑硫磺砂浆；在设计低水位以上、顶标高以下的海侧的钢圆筒及钢副格外壁的涂料上浇筑混凝土；在海侧的钢圆筒及钢副格外壁上分别焊接牺牲阳极块；在每个陆侧的钢圆筒及钢副格外壁的上部分别安装参比电极、焊接阴极焊点和零位焊点，将参比电极、零位焊点和阴极焊点的引出导线与阳极井内置预包装阳极体连接。采用本方法能够有效起到海中钢结构的长效防腐作用。