本发明公开了一种电磁频谱伞罩干扰机的自干扰序列选择系统与方法，所述系统包括多个电磁频谱伞罩授权电磁波设备、多个电磁频谱伞罩干扰机和电磁频谱伞罩管理控制中心；电磁频谱伞罩授权电磁波设备与电磁频谱伞罩干扰机之间通过无线信道连接，并与电磁频谱伞罩管理控制中心连接；电磁频谱伞罩干扰机和电磁频谱伞罩授权电磁波设备配置有包含多个电磁频谱伞罩自干扰信号特征的电磁频谱伞罩钥匙。本发明的授权电磁波设备能够识别正在工作的电磁频谱伞罩干扰机个数、功率和编号，并反馈给电磁频谱伞罩管理控制中心，电磁频谱伞罩管理控制中心根据电磁频谱伞罩干扰机个数、功率和编号，对电磁频谱伞罩干扰机发送的电磁频谱伞罩自干扰信号特征进行调整。