本发明涉及一种用于化学发光仪器的样本输送系统，上样输送机构具有自动控制启动上样输送带机构的第二微动开关；一对第一微动开关用于监测试管架是否到位及发生倾斜；L形推杆结构由伺服电机带动并能够推动试管架在样品处理区沿X向向前横向移动；退样互通结构具有用于检测试管架被L形推杆结构带动沿X向移动到位的第四微动开关，第四微动开关控制退样输送带机构启动；退样区域具有将试管架沿‑Y向输送退样输送带机构和用于检测试管架退样到位的第三微动开关。本发明上样自动化程度高，可与其他仪器实现流水线作业；采用多个微动开关，控制精确度高。