本发明具体涉及一种电解盐水制备纯氢气、氧气的系统及方法，所述装置包括储水装置、进水阀、进水泵、电解槽、阳极、阴极、脉冲电源、第一阀门、第一真空泵、第二阀门、第二真空泵、氢气收集装置、氧气收集装置；该方法采用脉冲电源供电操作模式，通电时仅产出氧气且在液相累积氢离子；随后断电仅产生氢气；通过阀门控制和真空泵收集两种气体分别进入气体收集装置；这种通电、断电操作连续进行，可制得大量纯的氢气和氧气；与常规电解水制氢设备及流程相比，本发明通过脉冲供电方式在省却气体分离设备的前提下实现了氢气、氧气两种气体的分离与纯化，也有效地减少了常规设备因膜污染、极化而引起的电压损失，大幅度降低了制氢电耗和设备成本。