本发明提供一种用于移动存储介质的防毒方法及防毒装置，属于计算机应用技术领域。该方法可包括的步骤有：通过硬件设备发出数据清除指令，微控制单元检测到所述清除指令，调用数据删除程序执行数据清除操作；然后通过硬件设备发出防病毒自动启动指令，微控制单元检测到所述防病毒自动启动指令，调用防病毒自动启动程序执行防病毒自动启动操作。该方法能快速对移动存储介质进行数据清除或防病毒启动处理，从而保证移动存储介质在安全等级较高的设备上安全使用。