一种多糖降解酶及其编码基因与应用以及一整套融合表达、纯化获取的方法，所述多糖降解酶名为Chond EI，编码基因获取迟缓爱德华氏菌(E.tarda)环境分离菌株，是具有序列表中序列2氨基酸残基序列的蛋白质，或者是将序列2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加具有与序列2的氨基酸残基序列相同活性的由序列2衍生的蛋白质，由海洋分离的爱德华氏菌克隆并表达纯化而制备的多糖降解酶酶Chond EI，具有产品活性高、稳定性好、生产周期短、成本低的特点，较易实现工业化生产。