本申请公开了一种电压波动指标测量方法及系统，包括：利用电压波动指标集，获取电网的电压波动指标；利用马尔卡夫转换模型，计算电压波动指标，得到预测电压波动指标；其中，马尔卡夫转换模型的生成过程包括：利用历史电压波动指标，生成初始概率分布，利用最大似然估计法和初始概率分布，对转移矩阵进行参数估计，得到转移矩阵中转移条件概率，利用历史电压波动指标和白噪声，采用最小二乘法得到回归系数，利用转移矩阵、回归系数和白噪声，生成马尔卡夫转换模型。本申请利用马尔卡夫转换模型，计算当前电压波动指标和上一时刻电压波动指标，从而得到预测电压波动指标，能够根据预测结果，采取相应的治理措施，保证了电力系统供电质量。