本发明提供一种3D打印喷头自动切换装置及其控制方法及3D打印机。一种3D打印喷头自动切换装置，其中，包括基座、至少两个3D打印喷头和至少两个用于支撑3D打印喷头的喷头保持架，所述基座设有与所述喷头保持架数量相对应的直线导轨，所述各喷头保持架对应设在所述各直线导轨上，所述各直线导轨上下两端与对应的喷头保持架相对应的位置分别设有第一电磁铁和第二电磁铁，所述喷头保持架能在所述对应的第一电磁铁和第二电磁铁的作用下沿所述直线导轨来回滑动。本发明以一种电磁驱动配合阻尼器的方式实现了3D打印喷头在打印过程中工作状态与待命状态之间的互换，从而避免了多喷头之间的干涉以及喷头与工作台面之间的干涉现象。