本发明提供了一种杭白菊秸秆发酵装置，属于农业机械技术领域。它解决了现有发酵装置加热、搅拌不均匀等技术问题。一种杭白菊秸秆发酵装置，本发酵装置包括发酵桶、驱动电机、主搅拌杆、辅搅拌杆、搅拌桨和温控水箱，主搅拌杆为中空结构，且通过花键与发酵桶的上端板连接，主搅拌杆内插设有一中空的导流杆，主搅拌杆与导流杆固定相连，导流杆将主搅拌杆的中空腔分隔为位于导流杆内部的进水通道和位于导流杆和主搅拌杆之间的出水通道，进水通道和出水通道的上端均连接温控水箱；驱动电机与导流杆之间设置有一个间歇性驱动导流杆在发酵桶内上下往复运动的离合结构。本发明具有加热、搅拌均匀等优点。