本发明属于海洋工程的基础结构技术领域，公开了一种组合式海上四浮筒浮箱基础结构及其施工方法，其基础结构包括四个在水平面上按照其中心点依次相连围成正方形进行布置的浮筒，每相邻两个浮筒之间连接有一个浮箱，浮箱沿长度方向的中心线穿过其两端浮筒的轴线；浮筒和浮箱上部连接有过渡段塔架，过渡段塔架用于连接上部风电设备；其施工方法包括预制结构、初调准备、水上托运、基础入水、负压沉贯、灌浆压载、安装上部结构、回收利用的步骤。本发明兼具重力式基础和吸力筒型基础的特点，承载力提高的同时，运输安装方式简便，可回收再利用，施工成本大大降低。