本发明涉及一种基于函数依赖的多样性数据修复方法，初始化修复集合；判断修复集合中的修复个数是否小于等于设定修复个数，若是，则初始化输入队列后进行下一步，否则进行最后一步；利用偏好函数w’(c)选择每个修复的修复元素，生成输入队列；利用Genrepair算法进行数据修复；判断修复集合中是否包含与本次相同的修复，若为是，则直接返回第二步，否则将本次修复操作加入修复集合，返回第二步；判断是否满足终止条件，若为是，则修复完成，否则对修复集合进行检查，并进行选取相应修复进行替换。与现有技术相比，本发明同时考虑多样性和代价进行数据修复、提高修复效率以及可以适用于指数级别的修复空间的有效动态采样等优点。