本发明公开了两对用于检测UCP1基因突变的PCR‑SSCP引物对，分别为P5、P6，其正反向引物的核苷酸序列为序列表中的SEQ ID NO.1‑4；同时还提供了其在牦牛肉质性状预测和鉴别方法中的应用及鉴定方法和相应的试剂盒。本发明的有益效果为：本发明参照普通牛的UCP1基因序列设计引物P5、P6，扩增牦牛UCP1基因，分析UCP1基因检测区域的序列及群体遗传特征，结合甘南牦牛肉生产性能测定数据，分析UCP1基因突变对其胴体及肉质性状的影响，丰富牦牛重要经济性状候选基因分子遗传研究数据，从而预测牦牛的肉质性状，反应灵敏、特异性强、操作简单、精确度高，可进行快速检测。