本发明提供了基于数据协同的继电保护缺陷诊断方法，属于通信领域，包括令缺陷诊断手持终端向服务器发送数据同步请求，缺陷诊断手持终端提取终端数据版本信息，服务器将终端数据版本信息与在线数据库内的服务数据数据版本信息进行对比；根据对比结果，将离线数据库中的数据进行更新；基于更新后的离线数据库对继电保护进行诊断。通过手持终端以及存储在服务器中在线数据库之间进行数据同步的方式，从而保证在具有联网通信能力时，令手持终端能够与在线数据库进行数据同步，使得手持终端内存储的离线数据库内的缺陷诊断数据尽可能保持最新，从而提高对继电保护进行诊断的准确性，进而提高维修进度，降低供电故障对生活生产供电造成的影响。