本发明提供一种柔性直流系统换流阀的三取二保护拓扑结构及方法，所述的三取二保护拓扑结构包括三个阀控保护装置和两个阀控装置；所述的三个阀控保护装置分别为第一阀控保护A套、第二阀控保护B套、第三阀控保护C套；所述的两个阀控装置分别为第一阀控A套和第二阀控B套。采用了三取二的保护方法，用三套阀控保护装置对两套互为冗余的阀控装置进行保护，如果要有保护动作输出，则需要三套阀控保护装置A、B、C中至少同时有两套发出了保护请求，此保护结构及方法用三取二的高可靠性模型代替了原来的二取一的保护方法，大大提高了换流阀保护的计算、管理的可靠性。