本发明公开了一种钼酸盐溶液或含钼钨酸盐溶液与三聚硫氰酸(盐)反应合成钼硫配合物的方法。在溶液体系中，钼酸盐与三聚硫氰酸(盐)进行硫代反应得到钼硫配合物，利用该反应可以将含钼钨酸盐溶液与三聚硫氰酸(盐)反应，将钼酸根离子选择性硫化，获得含钼硫配合物的钨酸盐溶液，该方法采用三聚硫氰酸(盐)作为硫化剂，反应过程无硫化氢等有害气体释放，完全消除H2S的生成，明显改善生产环境，且能使大量钨酸钠溶液中微量的钼选择性硫化，有利于后续采用萃取法、离子交换法或者沉淀法等进行钨钼分离。