本发明公开了一种淡水水生动物急性水质基准的推导方法，包括以下步骤：a、急性毒性数据的收集和筛选；步骤b、依次分别求出筛选出的急性毒性数据的属平均急性值及对应的累积概率；步骤c、以步骤b中求得的属平均急性值的自然对数为横坐标X，以其对应的累积概率P为纵坐标Y构造三次样条函数S(x)，对Y赋值，对应求得一个X值，对X取反对数，得短期危险浓度STHC100Y，即为针对目标污染物的急性水质基准值。本发明产生的有益效果是数据可信度高、计算过程简单、客观性强和实效精确性好，同时，克服了现有水质基准计算模型的不足，丰富了水质基准的计算方法，为科学地计算水质基准提供了技术支持。