本发明提供了一种削峰填谷控制方法和系统以及应用该控制方法的系统，包括基于预先建立的削峰填谷模型和与当前日对应的典型日负荷预测对预先设定变参数功率差控制策略中的可变控制参数求解；将获得的可变控制参数带入预先设定的变参数功率差控制策略中协调控制储能系统充放电功率。相对现有技术，本发明提供了一种变参数功率差控策略，该控制策略协调考虑了储能对负荷侧的削峰填谷效果以及荷电状态的影响，对储能系统正常工作上限荷电状态和储能系统正常工作下限荷电状态，及储能系统在不同负荷区间和不同荷电状态SOC区间的充电或放电功率因数进行变化寻优，能够保持储能系统的充放电特性，延长储能系统的使用寿命。