本发明公开了一种基于双层控制的备自投的投退方法，进行m次快速控制后，再进行一次慢速控制，不断循环；快速控制是以SCADA数据为控制依据，在设备负载超出限度时，退出往该设备转移负荷的关联备自投；慢速控制是以静态安全分析数据为控制依据，投入或退出部分备自投，保证设备N‑1故障后，备自投动作不会导致其余设备负载率超过限值。本发明采用双层控制的架构，既可以利用SCADA数据的快速性和相对准确性，又可以利用高软数据的全局性和分析性，可以大幅度提高备自投投退策略实施运行的可靠性。