本发明公开了一种海洋生物固碳计量方法，具体步骤包括将采集的海洋生物样品按不同物种进行分类，并分解为不同组织器官，将不同组织器官烘干处理，计算不同物种不同组织器官的湿质量比和干质量比，测出样品灰化前碳含量，对样品进行灰化处理后，测出样品灰化后碳含量，计算得出灰化前后湿样含碳率，再根据现存生物量估算出海洋生物现存碳储量、海洋生物捕捞移出碳储量、海洋生物沉积碳储量和海洋生物总碳储量。本发明的方法该简单容易操作，能够有效的估算海洋生物的储存碳的情况；同时对不同海洋动物的固碳能力以及海洋动物碳沉积进行研究，筛选出固碳能力较强的物种，为海洋牧场的模块化建设，碳汇估算和经营管理提供科学依据。