本发明公开了一种直流输电系统谐波不稳定的抑制系统及方法，解决了各种原因导致的直流输电的谐波不稳定的技术问题。其中，交流线路电流采集装置的输出端与附加谐波电流提取装置的输入端连接；附加谐波电流提取装置的输出端与附加谐波电流指令计算装置的输入端连接；直流电压偏差量采集装置的输出端与直流电压调节装置的输入端连接；直流电压调节装置的输出端与电流内环调节器的第一输入端连接；附加谐波电流指令计算装置的输出端与电流内环调节器的第一输入端连接；电流内环调节器的输出端与脉冲发生器的输入端连接；脉冲发生器的输出端与全控型逆变器的输入端连接。