本发明涉及一种微预应力管筋式土钉及其施工方法。一种微预应力管筋式土钉，包括花钢管、变截面钢筋、若干条连接钢筋和锚固结构；花钢管一端为锥形端头，另一端为开口端，花钢管的轴心设有变截面钢筋，连接钢筋将花钢管的开口端与变截面钢筋焊接为整体，花钢管管体表面设有出浆孔，花钢管管体外侧焊接有螺旋式钢肋，所述螺旋式钢肋紧邻锥形端头，花钢管外的变截面钢筋一端安装有钢垫板和固定螺帽，管筋式土钉施加有微预应力。变截面钢筋可提高管式土钉承载能力，同时通过螺帽对变截面钢筋施加微预应力，减小支护结构的变形。钢管采用机械旋转钻入土体，减小钢管入土难度及钢管在入土过程中的损耗，加快施工进度，增大砂浆加固体直径，提高抗拔力。