本发明提供一种新能源电站储能系统的综合能量管理方法及系统，包括：基于新能源电站当前功率和储能系统SOC的变化状态，分别计算跟踪计划出力对应的第一功率需求和平抑波动功能对应的第二功率需求；基于新能源电站当前功率计算削峰填谷功能对应的第三功率需求；基于所述第一功率需求、第二功率需求和第三功率需求确定储能系统功率需求。本发明实现了可以同时应用于实现跟踪计划出力、削峰填谷和平抑波动功能，保证储能系统的SOC在一个完整调度周期内不越限，保证新能源出力一直处于可控状态。