一种带加热恒温系统的多层生物滤池及其使用方法，适用于严寒地区，包括生物滤池、废气输送系统、输水系统和加热恒温系统，加热恒温系统包括加热装置、感温装置和温控中心，加热装置和感温装置配套设置在循环水箱和喷淋水箱内；二级生物处理池由上下多个单元降解层串联而成，每层设置生物填料层和喷淋层，上层生物填料层之下设滤网和喷淋液回收层，喷淋液回收层与循环水箱连接。本发明设置加热恒温系统，对箱内水体加热，使气体升温，提高了降解效率，解决了严寒地区气体温度低于生物滤池设计温度的问题；将二级生物处理池设为多层，空间利用率大大提升，降低了生物除臭成本；设置喷淋液回收层，二级生物处理中的喷淋液进行回收，节约了水资源。