本发明公开了一种适用于污染土浅层搅拌的分区分层原位修复方法，包括以下步骤：将施工区域划分为若干呈网格状的修复单元；根据各修复单元的污染深度划分为至少两个搅拌层，即上层污染土体和下层污染土体；利用挖机将待施工修复单元内的上层污染土体挖除；对下层污染土体进行疏松翻搅并投加修复药剂，使两者充分接触，完成下层污染土体的修复；利用挖机回填上层污染土体，将上层污染土体进行疏松翻搅并投加修复药剂，直至完成该修复单元的修复；按照前述方法依次完成各修复单元内的注药搅拌修复工作并进行养护。本发明的优点是：通过对施工区域内的污染土体进行分单元、分层次进行加药原位搅拌，从而可保证搅拌混合的均匀性。