本发明公开了一种用于处理丙烯醛反应器废水的方法，包括以下步骤：S1、将丙烯醛反应器废水与碳酸盐水溶液混合得到混合溶液，其中丙烯醛反应器废水pH值小于2，含有：丙烯醛500～3000ppm、烯丙醇50～800ppm、丙烯酸40000～100000ppm、甲醛10000～30000ppm、乙酸3000～10000ppm、马来酸3000～8000ppm；并且混合溶液的pH为4～6，COD浓度为7500ppm～30000ppm，甲醛浓度为800ppm～4000ppm；S2、将步骤S1得到的混合溶液输送到厌氧反应器中进行生化处理；和S3、将经过步骤S2处理的溶液输送到好氧生化槽中进行处理；任选地，将经步骤S2和/或S3处理后的溶液的至少一部分回流至步骤S2中。本发明还公开了一种用于处理丙烯醛反应器废水的装置。