本发明涉及大型输水工程设计及运行，尤其是涉及一种大型输水工程突发事故应急调度方法及监控系统。该监控系统包括输水通道、节制/事故闸、退水通道、退水闸/阀、通道控制线路、通道监测线路。设在输水通道上的监测装置，实时监测通道内监测点的流量和水位信息，并通过输水通道监测线路传输至控制器。设在退水通道上的监测装置，实时监测通道内监测点的水位信息，并通过退水通道监测线路传输至控制器。控制器根据收到的监测信息，根据调度逻辑，形成命令经由输水控制线路，实时操作节制/事故闸的关闭过程和速度；经由退水控制线路实时操作退水闸/阀开度大小，保障输水通道、退水通道在事故发生时快速控制险情、避免次生破坏。