本发明公开了传染病控制技术领域中一种关于伤寒与副伤寒肠道传染病疫情的精准控制方法，通过综合运用流行病学、环境卫生学、微生物学、分子生物学、传染病学五个病因学科理论技术，获得传播循环或病原体流动的病因分化与融合双向性结果结论，调查分析提高了病因研究精准性，明确病原体型及其来源，并为确定污染源、传播环节、跨地区扩散提供依据；通过划分传播危险性病例与携带者和公共卫生管理，把传染源划分为高度传播危险性病例与携带者和一般病例与携带者，对高度传播危险性病例与携带者和一般病例与携带者实施分层次隔离治疗、住院治疗、粪便检测与携带状态清除程序的公共卫生管理，更加科学和有针对性。