本发明提供了一种基于逆变器的电网故障处理方法及系统，该基于逆变器的电网故障处理方法包括：获取逆变器交流侧的电流值，判断电流值是否超过预设的限流定值；当电流值超过限流定值时，控制逆变器向母线分段开关发送禁止合闸信号，并进入主动电压控制模式；检测第一分段母线的电压检测值，根据电压检测值与预设电压值的大小关系确定逆变器处于主动电压控制模式的时间；当时间小于预设的短时限流时间时，控制逆变器撤销禁止合闸信号。通过实施本发明，在电网方式故障时，可以有效的保护逆变器，并且增大母线故障的识别率，从而防止故障范围和停电范围的扩大，进而保障了电网的运行效率。