本发明公开了一种水体光学衰减系数测量装置及方法，该装置包括光源、探测器、与探测器连接且带动探测器移动的第一驱动机构和第二驱动机构，沿光路设于探测器的前方且与第一驱动机构连接的光斑尺寸探测单元，以及与探测器和光斑尺寸探测单元连接的中央处理器，第一驱动机构带动探测器沿光路移动，第二驱动机构带动探测器沿垂直光轴的平面进行移动扫描，探测器的探测面的尺寸小于所需探测的光斑的尺寸。通过光斑尺寸探测单元探测光斑的尺寸，接着第二驱动机构带动探测器进行移动扫描，获得整个光斑的参数信息，通过第一驱动机构带动探测器沿光路移动，测量不同距离对应的参数信息数据，针对得到的多组测量数据进行拟合，得到水体的光学衰减系数值。