本发明提供一种用于跨应用远程访问电力二次系统的方法和系统，所述方法包括：通过应用虚拟化技术对应用虚拟化服务端的电力二次系统应用程序进行虚拟化；应用交付单元对在应用虚拟化服务端的电力二次系统应用程序进行注册发布和对远程用户进行权限管理；应用虚拟化客户端获取远程访问用户的人机交互逻辑并在对其封装后传输至应用虚拟化服务端；应用虚拟化服务端启动并执行电力二次系统应用程序，以及将所述执行结果通过应用交付单元传输至应用虚拟化客户端。所述方法和系统采用基于应用虚拟化的远程调控技术，通过构建应用交付单元、应用虚拟化服务端和应用虚拟化客户端，实现了涵盖电力二次系统各级子系统的一体化远程监视、控制和管理。