本发明提供一种基于心脏磁共振电影短轴图像的右心室多图谱分割方法，利用磁共振成像系统采集被试人一定数量的心脏原始磁共振图像，提取感兴趣区域。在原始磁共振图像中选取固定数量的右心室的图谱图像加入图谱集，专家手动分割所述图谱图像获得专家手动分割结果。图谱图像与目标图像采用基于归一化互信息的B样条变换得到右心室粗分割结果，对粗分割结果采用COLLATE融合，先对完整数据进行对数似然估计，然后再利用最大期望算法迭代求解直至收敛，并进行修正处理获得右心室最终分割结果。本发明具有更高的鲁棒性，并能够提高融合的准确度和精确性，用于精确分割心脏右心室短轴图像。