本发明公开了一种生物基静电耗散聚酯及其制备方法，包括以下原料组分：2,5‑呋喃二甲酸、脂肪二元醇、聚醚、结构改性剂、催化剂、稳定剂；还包括对苯二甲酸、间苯二甲酸和无机盐。其制备方法包括以下步骤：(1)酯化反应：将2,5‑呋喃二甲酸与脂肪二元醇两者配制，同时加入催化剂，混合搅拌均匀后，进行酯化反应，出水量达到理论出水量的95％视为酯化反应结束，制得聚酯母液；(2)缩聚反应：将结构改性剂、稳定剂与聚醚相混合，搅拌均匀后加入到所述聚酯母液中，进行缩聚；(3)反应结束后，熔体经氮气保护出料，冷却，切粒，干燥，得到生物基静电耗散聚酯。所得产品具备绿色环保性能、良好的静电耗散能力和力学性能。