本发明涉及一种着生藻类多功能采集仪器，其包括采集筒、自动旋转刷、取液器和抽气泵；所述采集筒包括外环壁、内环壁、抽气管、外壁吸盘、内壁吸盘和固定塞；所述自动旋转刷自由插装于所述采集筒内侧，其由旋转柱、安装于所述旋转柱上端的电动手柄、安装于所述电动手柄上的启动钮以及匹配安装于所述旋转柱下端的刚刷组成。本发明结构设计简单、合理，拆卸方便，便于携带，定性及定量取样时安全性高，精确度高，误差小，坚固耐用，操作简单，适合多种水域环境着生藻类的采取。