本发明提供了一种光伏电站的缺陷诊断方法及装置，其中，该方法包括：采集待诊断光伏电站运行过程中的测试数据；根据测试数据，确定待诊断光伏电站年效能PR值，待诊断光伏电站的每一发电单元的PR值，以及每一发电单元包括的组成部件的PR值、加权效率、并联失配损失或串联失配损失；基于PR评价阈值模型，根据待诊断光伏电站PR值、待诊断光伏电站的每一发电单元的PR值，以及每一发电单元包括的组成部件的PR值、加权效率、并联失配损失或串联失配损失，对待诊断光伏电站进行逐层诊断定位缺陷；所述PR评价阈值模型基于光伏电站现场实测数据预先确定。上述技术方案实现了从运行层面对光伏电站的缺陷检测，提高了光伏电站缺陷诊断的效率。