本发明提出了一种行波保护测试装置输出同步性的测试系统和测试方法。其中，行波保护测试装置输出同步性的测试系统包括：输入数据提供单元，输入数据提供单元与行波保护测试装置电连接，用于提供预设输入信号至行波保护测试装置；输出数据获取单元，输出数据获取单元与行波保护测试装置电连接，用于获取行波保护测试装置同一电气参数输出通道中多个输出通道输出的电气参数数据；比较单元，用于比较多个输出通道输出的电气参数数据，以确定其同步性。本发明实现了对行波保护测试装置各路电气参数同步性的测试，避免了同步性不高的行波保护测试装置对行波保护和测距装置的测试校验产生不可信的结果。